昌都縣位于西藏東部，地處橫斷山脈和三江（金沙江、瀾滄江、怒江）流域，素有“藏東明珠”的美稱。自清末改土歸流置昌都府以來，昌都縣便一直是昌都地區(qū)的政治、經(jīng)濟(jì)、文化和交通中心，享有“藏東門戶”的盛譽(yù)。以昌都鎮(zhèn)為中心，東與四川省相望，東南面與緬甸及云南接壤，西南面與西藏林芝地區(qū)毗鄰，西北與西藏那曲地區(qū)相連，北面與青海省交界，西望西藏自治區(qū)首府拉薩，處在商貿(mào)往來的樞紐地位。

    昌都縣位于橫斷山脈西北部、青藏高原東南部的邊緣地帶，地勢(shì)北高南低，東西呈“W”形。最高海拔6100米，最低海拔2900米，平均海拔3500米。境內(nèi)地形復(fù)雜多樣，切割明顯，險(xiǎn)峰峻嶺，溝壑縱橫，蔚為奇觀。昌都城鎮(zhèn)環(huán)山而抱，傍水而依，頗具“山城”的秀麗，又具“江城”的風(fēng)采。

    昌都縣水資源異常豐富，“三江”支流密布，常年平均流量達(dá)400立方米/秒，總流量達(dá)152億立方米/秒。扎曲河、昂曲河屬瀾滄江水系，均發(fā)源于青海省，由西北向東南流至昌都鎮(zhèn)匯合，始稱瀾滄江。扎曲河流徑境內(nèi)長(zhǎng)達(dá)145公里，昂曲河、瀾滄江和金河則分別流徑境內(nèi)長(zhǎng)達(dá)85公里、50公里和60公里?！叭右唤倍啻┰礁呱綅{谷，多急流險(xiǎn)灘，落差大，便于綜合開發(fā)利用。據(jù)統(tǒng)計(jì)，水能蘊(yùn)藏量均在5萬千瓦以上。

    昌都縣屬中緯度地區(qū)，因受地形的影響，高原寒溫帶季風(fēng)性氣候混雜?！耙簧接兴募荆锊煌臁?，山頂終年白雪皚皚，山腰森林茂密，山腳草木叢生，山谷則呈現(xiàn)出亞熱帶特征，雨熱同季，氣候宜人。夏季溫和多雨，冬季日照充足，年均氣溫7.5℃，日均氣溫5℃，無霜期127天，年均降水量477.7毫米。

    昌都縣特殊的地質(zhì)、氣候、土壤等自然條件，決定了在縣境內(nèi)蘊(yùn)藏著豐富的藥用資源和種類繁多的野生動(dòng)物，是一個(gè)豐富的自然寶庫。 其境內(nèi)不僅森林資源豐富，而且藥材資源也極為豐富，全縣轄15個(gè)鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），208個(gè)行政村，分布有各種名貴的大小中藥材。日通藏藥廠研制中心現(xiàn)已成功研制出了 "二十五味珍珠丸"、"二十五味松石丸"、"二十五味珊瑚丸"、"智托潔白丸"、"二十五味馬寶丸（腹中寶）"、"如意珍寶丸"、"補(bǔ)腎丸"、"智托潔白丸"、"仁青常覺"、"珍珠七十丸"等《日通》牌名貴藏藥，其中"二十五味松石丸"和"二十五味馬寶丸"曾在自治區(qū)名優(yōu)產(chǎn)品展銷會(huì)上榮獲自治區(qū)名優(yōu)產(chǎn)品稱號(hào)。其它名貴藏藥其適應(yīng)癥廣、療效顯著（特別是對(duì)消化系統(tǒng)和風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等有獨(dú)特療效）、無毒副作用，深受區(qū)內(nèi)外患者青睞。